Pengenalpastian dan profil pengekspresan gen biosintesis asid amino yis psikrofil, Glaciozyma antarctica

Mekanisme pengambilan dan penghasilan asid amino bagi mikroorganisma psikrofil yang bermandiri dan berpoliferasi pada persekitaran sejuk melampau masih belum difahami sepenuhnya. Objektif kajian ini ialah untuk mengenal pasti gen yang terlibat dalam penjanaan asid amino bagi yis psikrofil, Glaciozym...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: Izwan Bharudin, Radziah Zolkefli, Mohd Faizal Abu Bakar, Shazilah Kamaruddin, Rosli Md. Illias, Nazalan Najimudin, Nor Muhammad Mahadi, Farah Diba Abu Bakar, Abdul Munir Abdul Murad
Format: Article
Language:English
Published: Penerbit Universiti Kebangsaan Malaysia 2018
Online Access:http://journalarticle.ukm.my/12188/
http://journalarticle.ukm.my/12188/
http://journalarticle.ukm.my/12188/1/06%20Izwan%20Bharudin.pdf
id ukm-12188
recordtype eprints
spelling ukm-121882018-10-16T13:06:20Z http://journalarticle.ukm.my/12188/ Pengenalpastian dan profil pengekspresan gen biosintesis asid amino yis psikrofil, Glaciozyma antarctica Izwan Bharudin, Radziah Zolkefli, Mohd Faizal Abu Bakar, Shazilah Kamaruddin, Rosli Md. Illias, Nazalan Najimudin, Nor Muhammad Mahadi, Farah Diba Abu Bakar, Abdul Munir Abdul Murad, Mekanisme pengambilan dan penghasilan asid amino bagi mikroorganisma psikrofil yang bermandiri dan berpoliferasi pada persekitaran sejuk melampau masih belum difahami sepenuhnya. Objektif kajian ini ialah untuk mengenal pasti gen yang terlibat dalam penjanaan asid amino bagi yis psikrofil, Glaciozyma antarctica serta menentukan pengekspresan gen tersebut semasa kehadiran dan kekurangan asid amino dalam medium pertumbuhan. Pengenalpastian gen telah dilakukan melalui penjanaan penanda jujukan terekspres (ESTs) daripada dua perpustakaan cDNA yang dibina daripada sel yang dikultur dalam medium pertumbuhan kompleks dan medium pertumbuhan minimum tanpa asid amino. Sebanyak 3552 klon cDNA daripada setiap perpustakaan dipilih secara rawak untuk dijujuk menghasilkan 1492 transkrip unik (medium kompleks) dan 1928 transkrip unik (medium minimum). Analisis pemadanan telah mengenl pasti gen mengekod protein yang terlibat di dalam pengambilan asid amino bebas, biosintesis asid amino serta gen yang terlibat dengan kitar semula asid amino berdasarkan tapak jalan yang digunakan oleh yis model, Saccharomyces cerevisiae. Analisis pengekspresan gen menggunakan kaedah RT-qPCR menunjukkan pengekspresan gen mengekod protein yang terlibat di dalam pengambilan asid amino bebas iaitu permease adalah tinggi pada medium kompleks manakala pengekspresan kebanyakan gen mengekod protein yang terlibat dalam kitar semula dan biosintesis asid amino adalah tinggi di dalam medium minimum. Kesimpulannya, gen yang terlibat dalam penjanaan dan pengambilan asid amino bagi mikroorganisma psikrofil adalah terpulihara seperti mikroorganisma mesofil dan pengekspresan gen-gen ini adalah diaruh oleh kehadiran atau ketiadaan asid amino bebas pada persekitaran. Penerbit Universiti Kebangsaan Malaysia 2018-08 Article PeerReviewed application/pdf en http://journalarticle.ukm.my/12188/1/06%20Izwan%20Bharudin.pdf Izwan Bharudin, and Radziah Zolkefli, and Mohd Faizal Abu Bakar, and Shazilah Kamaruddin, and Rosli Md. Illias, and Nazalan Najimudin, and Nor Muhammad Mahadi, and Farah Diba Abu Bakar, and Abdul Munir Abdul Murad, (2018) Pengenalpastian dan profil pengekspresan gen biosintesis asid amino yis psikrofil, Glaciozyma antarctica. Sains Malaysiana, 47 (8). pp. 1675-1684. ISSN 0126-6039 http://www.ukm.my/jsm/english_journals/vol47num8_2018/contentsVol47num8_2018.html
repository_type Digital Repository
institution_category Local University
institution Universiti Kebangasaan Malaysia
building UKM Institutional Repository
collection Online Access
language English
description Mekanisme pengambilan dan penghasilan asid amino bagi mikroorganisma psikrofil yang bermandiri dan berpoliferasi pada persekitaran sejuk melampau masih belum difahami sepenuhnya. Objektif kajian ini ialah untuk mengenal pasti gen yang terlibat dalam penjanaan asid amino bagi yis psikrofil, Glaciozyma antarctica serta menentukan pengekspresan gen tersebut semasa kehadiran dan kekurangan asid amino dalam medium pertumbuhan. Pengenalpastian gen telah dilakukan melalui penjanaan penanda jujukan terekspres (ESTs) daripada dua perpustakaan cDNA yang dibina daripada sel yang dikultur dalam medium pertumbuhan kompleks dan medium pertumbuhan minimum tanpa asid amino. Sebanyak 3552 klon cDNA daripada setiap perpustakaan dipilih secara rawak untuk dijujuk menghasilkan 1492 transkrip unik (medium kompleks) dan 1928 transkrip unik (medium minimum). Analisis pemadanan telah mengenl pasti gen mengekod protein yang terlibat di dalam pengambilan asid amino bebas, biosintesis asid amino serta gen yang terlibat dengan kitar semula asid amino berdasarkan tapak jalan yang digunakan oleh yis model, Saccharomyces cerevisiae. Analisis pengekspresan gen menggunakan kaedah RT-qPCR menunjukkan pengekspresan gen mengekod protein yang terlibat di dalam pengambilan asid amino bebas iaitu permease adalah tinggi pada medium kompleks manakala pengekspresan kebanyakan gen mengekod protein yang terlibat dalam kitar semula dan biosintesis asid amino adalah tinggi di dalam medium minimum. Kesimpulannya, gen yang terlibat dalam penjanaan dan pengambilan asid amino bagi mikroorganisma psikrofil adalah terpulihara seperti mikroorganisma mesofil dan pengekspresan gen-gen ini adalah diaruh oleh kehadiran atau ketiadaan asid amino bebas pada persekitaran.
format Article
author Izwan Bharudin,
Radziah Zolkefli,
Mohd Faizal Abu Bakar,
Shazilah Kamaruddin,
Rosli Md. Illias,
Nazalan Najimudin,
Nor Muhammad Mahadi,
Farah Diba Abu Bakar,
Abdul Munir Abdul Murad,
spellingShingle Izwan Bharudin,
Radziah Zolkefli,
Mohd Faizal Abu Bakar,
Shazilah Kamaruddin,
Rosli Md. Illias,
Nazalan Najimudin,
Nor Muhammad Mahadi,
Farah Diba Abu Bakar,
Abdul Munir Abdul Murad,
Pengenalpastian dan profil pengekspresan gen biosintesis asid amino yis psikrofil, Glaciozyma antarctica
author_facet Izwan Bharudin,
Radziah Zolkefli,
Mohd Faizal Abu Bakar,
Shazilah Kamaruddin,
Rosli Md. Illias,
Nazalan Najimudin,
Nor Muhammad Mahadi,
Farah Diba Abu Bakar,
Abdul Munir Abdul Murad,
author_sort Izwan Bharudin,
title Pengenalpastian dan profil pengekspresan gen biosintesis asid amino yis psikrofil, Glaciozyma antarctica
title_short Pengenalpastian dan profil pengekspresan gen biosintesis asid amino yis psikrofil, Glaciozyma antarctica
title_full Pengenalpastian dan profil pengekspresan gen biosintesis asid amino yis psikrofil, Glaciozyma antarctica
title_fullStr Pengenalpastian dan profil pengekspresan gen biosintesis asid amino yis psikrofil, Glaciozyma antarctica
title_full_unstemmed Pengenalpastian dan profil pengekspresan gen biosintesis asid amino yis psikrofil, Glaciozyma antarctica
title_sort pengenalpastian dan profil pengekspresan gen biosintesis asid amino yis psikrofil, glaciozyma antarctica
publisher Penerbit Universiti Kebangsaan Malaysia
publishDate 2018
url http://journalarticle.ukm.my/12188/
http://journalarticle.ukm.my/12188/
http://journalarticle.ukm.my/12188/1/06%20Izwan%20Bharudin.pdf
first_indexed 2023-09-18T20:02:03Z
last_indexed 2023-09-18T20:02:03Z
_version_ 1777406914132443136