Analisis dan penyaringan data lewah interaksi kelompok bes berikatan hidrogen dalam struktur RNA 3-dimensi

Susun atur 3-dimensi (3D) yang sama boleh disalah cerap sebagai berbeza dari sudut penglihatan yang berlainan. Bagi makromolekul biologi, permasalahan ini juga dihadapi oleh algoritma pencarian susun atur 3D. Keputusan hasil larian yang sama akan diperoleh berulang kali (data lewah) kerana hasil ter...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors:	Hazrina Yusof Hamdani, Mohd Firdaus-Raih
Format:	Article
Language:	English
Published:	Penerbit Universiti Kebangsaan Malaysia 2018
Online Access:	http://journalarticle.ukm.my/12194/ http://journalarticle.ukm.my/12194/ http://journalarticle.ukm.my/12194/1/12%20Hazrina%20Yusof%20Hamdani.pdf

id	ukm-12194
recordtype	eprints
spelling	ukm-121942018-10-16T13:40:24Z http://journalarticle.ukm.my/12194/ Analisis dan penyaringan data lewah interaksi kelompok bes berikatan hidrogen dalam struktur RNA 3-dimensi Hazrina Yusof Hamdani, Mohd Firdaus-Raih, Susun atur 3-dimensi (3D) yang sama boleh disalah cerap sebagai berbeza dari sudut penglihatan yang berlainan. Bagi makromolekul biologi, permasalahan ini juga dihadapi oleh algoritma pencarian susun atur 3D. Keputusan hasil larian yang sama akan diperoleh berulang kali (data lewah) kerana hasil tersebut boleh mempunyai susun atur jujukan berbeza. Permasalahan ini tidak ditemui di dalam pencarian jujukan. Dalam kajian ini, dua kaedah untuk menyaring data lewah tersebut telah dibangunkan dan dibandingkan iaitu kod Prüfer (berasaskan teori graf) dan kaedah saringan data lewah (dibangunkan secara khusus untuk kajian). Model hasil carian pula adalah menggunakan COnnection tables Graphs for Nucleic ACids (COGNAC) bagi pencarian interaksi kelompok bes berikatan hidrogen. Perbandingan yang dilakukan menunjukkan bahawa kaedah saringan data lewah mampu untuk mengenal pasti dan menyaring antara 50.5% sehingga 80% data lewah daripada hasil larian asal COGNAC berbanding kod Prüfer yang hanya mengenal pasti dan menyaring 50% data lewah daripada hasil larian asal COGNAC. Oleh itu, kaedah saringan data lewah telah diimplementasi ke dalam COGNAC. Selain itu, kaedah saringan data lewah ini juga boleh diguna pakai untuk algoritma yang tidak bergantung kepada jujukan bagi pencarian motif 3D dalam struktur protein. Penerbit Universiti Kebangsaan Malaysia 2018-08 Article PeerReviewed application/pdf en http://journalarticle.ukm.my/12194/1/12%20Hazrina%20Yusof%20Hamdani.pdf Hazrina Yusof Hamdani, and Mohd Firdaus-Raih, (2018) Analisis dan penyaringan data lewah interaksi kelompok bes berikatan hidrogen dalam struktur RNA 3-dimensi. Sains Malaysiana, 47 (8). pp. 1731-1739. ISSN 0126-6039 http://www.ukm.my/jsm/english_journals/vol47num8_2018/contentsVol47num8_2018.html
repository_type	Digital Repository
institution_category	Local University
institution	Universiti Kebangasaan Malaysia
building	UKM Institutional Repository
collection	Online Access
language	English
description	Susun atur 3-dimensi (3D) yang sama boleh disalah cerap sebagai berbeza dari sudut penglihatan yang berlainan. Bagi makromolekul biologi, permasalahan ini juga dihadapi oleh algoritma pencarian susun atur 3D. Keputusan hasil larian yang sama akan diperoleh berulang kali (data lewah) kerana hasil tersebut boleh mempunyai susun atur jujukan berbeza. Permasalahan ini tidak ditemui di dalam pencarian jujukan. Dalam kajian ini, dua kaedah untuk menyaring data lewah tersebut telah dibangunkan dan dibandingkan iaitu kod Prüfer (berasaskan teori graf) dan kaedah saringan data lewah (dibangunkan secara khusus untuk kajian). Model hasil carian pula adalah menggunakan COnnection tables Graphs for Nucleic ACids (COGNAC) bagi pencarian interaksi kelompok bes berikatan hidrogen. Perbandingan yang dilakukan menunjukkan bahawa kaedah saringan data lewah mampu untuk mengenal pasti dan menyaring antara 50.5% sehingga 80% data lewah daripada hasil larian asal COGNAC berbanding kod Prüfer yang hanya mengenal pasti dan menyaring 50% data lewah daripada hasil larian asal COGNAC. Oleh itu, kaedah saringan data lewah telah diimplementasi ke dalam COGNAC. Selain itu, kaedah saringan data lewah ini juga boleh diguna pakai untuk algoritma yang tidak bergantung kepada jujukan bagi pencarian motif 3D dalam struktur protein.
format	Article
author	Hazrina Yusof Hamdani, Mohd Firdaus-Raih,
spellingShingle	Hazrina Yusof Hamdani, Mohd Firdaus-Raih, Analisis dan penyaringan data lewah interaksi kelompok bes berikatan hidrogen dalam struktur RNA 3-dimensi
author_facet	Hazrina Yusof Hamdani, Mohd Firdaus-Raih,
author_sort	Hazrina Yusof Hamdani,
title	Analisis dan penyaringan data lewah interaksi kelompok bes berikatan hidrogen dalam struktur RNA 3-dimensi
title_short	Analisis dan penyaringan data lewah interaksi kelompok bes berikatan hidrogen dalam struktur RNA 3-dimensi
title_full	Analisis dan penyaringan data lewah interaksi kelompok bes berikatan hidrogen dalam struktur RNA 3-dimensi
title_fullStr	Analisis dan penyaringan data lewah interaksi kelompok bes berikatan hidrogen dalam struktur RNA 3-dimensi
title_full_unstemmed	Analisis dan penyaringan data lewah interaksi kelompok bes berikatan hidrogen dalam struktur RNA 3-dimensi
title_sort	analisis dan penyaringan data lewah interaksi kelompok bes berikatan hidrogen dalam struktur rna 3-dimensi
publisher	Penerbit Universiti Kebangsaan Malaysia
publishDate	2018
url	http://journalarticle.ukm.my/12194/ http://journalarticle.ukm.my/12194/ http://journalarticle.ukm.my/12194/1/12%20Hazrina%20Yusof%20Hamdani.pdf
first_indexed	2023-09-18T20:02:04Z
last_indexed	2023-09-18T20:02:04Z
_version_	1777406915008004096

Analisis dan penyaringan data lewah interaksi kelompok bes berikatan hidrogen dalam struktur RNA 3-dimensi

Similar Items